昆虫学报

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:11-1832/Q

国际刊号:0454-6296

昆虫学报杂志2025年第1期:中华按蚊GR基因家族的全基因组鉴定及特性分析

发布日期:

作者:牟肖,任爽,陈斌

单位:重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所, 媒介生物控制和利用重庆市重点实验室, 重庆 401331

关键词:中华按蚊,味觉受体,全基因组鉴定,基因特征,系统发育

【目的】在全基因组水平上鉴定中华按蚊Anopheles sinensis味觉受体(gustatory receptor, GR)蛋白家族基因,分析GR基因家族成员的结构和特征,预测其家族成员可能的生物学功能,为中华按蚊GR基因家族提供信息框架。【方法】从NCBI和Vectorbase数据库中下载冈比亚按蚊An. gambiae、致倦库蚊Culex quinquefasciatus、埃及伊蚊Aedes aegypti和黑腹果蝇Drosophila melanogaster已知的GR氨基酸序列作为询问序列,通过Blast和HMM方法在全基因组水平上搜索和鉴定中华按蚊的GR家族基因并命名;通过生物信息学方法预测中华按蚊GR基因的基本特征(理化性质、基因结构及基因组定位)、保守结构域及Ka/Ks比值等;通过MEGA软件运用最大似然法构建中华按蚊和冈比亚按蚊GR基因编码蛋白系统发育树。【结果】中华按蚊基因组中共筛选鉴定出54个GR基因。参考冈比亚按蚊分类和基于系统发生关系,将中华按蚊AsGRs分为CO2受体、苦味受体、糖受体和信息素受体4个亚家族,分别有3, 40, 6和5个受体。其中CO2受体和糖受体聚成一支,信息素受体聚类成一个分支,而苦味受体则分散在整个系统发育树中。54个中华按蚊GR基因定位在Chr.1和Chr.2染色体上; AsGRs的氨基酸数量为128~3 429, 分子量是14.85~397.08 kD, 理论等电点(pI)为5.16~9.84,亲水性指数(GRAVY)介于-0.023~0.838; 54个中华按蚊AsGR基因的外显子数量为1~23个,跨度较大。大部分中华按蚊与冈比亚按蚊直系同源基因对的Ka/Ks比值都小于1,说明中华按蚊GR家族基因在进化过程中主要是受到纯化选择的作用。【结论】本研究对中华按蚊GR基因家族进行全基因组鉴定和特征分析,丰富了中华按蚊基因组数据库,为后续中华按蚊GR基因的功能研究奠定了一定基础。

来源:2025年第1期

《昆虫学报》期刊编辑部

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