昆虫学报

作者：邓美菁,赵萍

单位：1.南宁师范大学, 环境与生命科学学院, 南宁 530100; 2. 南宁师范大学, 地理与海洋研究院, 南宁 530100

关键词：刺猎蝽属,高通量测序,转录组,差异表达基因

【目的】建立刺猎蝽属Sclomina 3种的转录组数据库，分析近缘种间转录组表达差异，探讨在转录组水平的种间趋异情况。【方法】采用Illumina HiSeqTM4000高通量测序平台进行刺猎蝽属齿缘刺猎蝽S. erinacea、兴仁刺猎蝽S. xingrensis和广西刺猎蝽S. guangxiensis 3种转录组测序；利用Nr, Swiss-Prot, COG/KOG和KEGG 数据库进行基因功能注释；对种间差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。【结果】齿缘刺猎蝽、兴仁刺猎蝽和广西刺猎蝽转录组测序组装获得42 215个unigenes。21 117个基因在上述4个数据库中得到注释(各数据库注释基因数为： Nr， 20 522； Swiss-Prot， 15 550； COG/KOG， 13 969; KEGG，10 850)。兴仁刺猎蝽vs齿缘刺猎蝽转录组有3 390个DEGs (803个上调，2 587个下调)，兴仁刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组有12 543个DEGs (6 639个上调，5 904个下调)，齿缘刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组有3 580个DEGs(2 485个上调，1 095个下调)。GO功能注释结果显示，上述DEGs被注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3个功能大类和功能亚类，兴仁刺猎蝽vs齿缘刺猎蝽转录组中DEGs分别注释到代谢过程、细胞和细胞部分等50个功能亚类中，下调基因多，上调基因少；兴仁刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组中DEGs被注释到生物学过程、细胞部分和细胞等54个功能亚类中；齿缘刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组中DEGs被分别注释到细胞部分、代谢过程等46个功能亚类中。6 254个DEGs被注释到KEGG代谢通路，涉及多个不同的代谢通路，包括代谢通路、药物代谢细胞色素P450、核糖体等；兴仁刺猎蝽vs齿缘刺猎蝽转录组702个DEGs富集到164个KEGG通路；兴仁刺猎蝽 vs广西刺猎蝽转录组中2 091个DEGs富集得到201个KEGG通路；齿缘刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组中865个DEGs富集得到129个KEGG通路；兴仁刺猎蝽vs广西刺猎蝽转录组DEGs富集到代谢通路、药物代谢细胞色素P450和核糖体等KEGG通路的数量最多。【结论】本研究结果丰富了刺猎蝽属的分子生物学数据；在转录组水平上呈现了齿缘刺猎蝽、兴仁刺猎蝽和广西刺猎蝽的种间差异，探索了该属物种分化的实际情况。

来源：2023年第9期

《昆虫学报》期刊编辑部

查看昆虫学报杂志2023年第9期