昆虫学报

作者：张文德,赵浩东,孙明会,余岢骏,郭意龙,朱乐冉,胡颖,赵萧,叶亚萍,陈大福,郭睿

单位：1. 福建农林大学动物科学学院蜂学学院,福州350002; 2. 福建农林大学蜂疗研究所, 福州 350002

关键词：蜜蜂,宿主,东方蜜蜂微孢子虫,小RNA测序,微小RNA,调控

【目的】丰富东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的微小RNA(microRNA, miRNA)信息，并为深入探究miRNA在病原孢子和病原侵染中的功能提供理论和实验依据。【方法】基于已获得的small RNA-seq数据，利用生物信息学软件对东方蜜蜂微孢子虫的纯净孢子中的miRNA进行鉴定和分析。采用茎环反转录PCR(stem-loop RT-PCR)检测已鉴定的miRNA的表达；通过分子克隆与Sanger测序验证miRNA的序列。使用TargetFinder软件预测这些miRNA的靶基因，并对靶基因进行数据库注释。根据miRNA与靶基因的靶向结合关系构建调控网络，再利用Cytoscape软件进行可视化。【结果】在东方蜜蜂微孢子虫孢子中共鉴定到10个miRNA；这些miRNA的长度分布介于21~25 nt，首位碱基表现出U偏向性，每一位碱基的偏向性差异明显。Stem-loop RT-PCR检测结果表明这10个miRNA均真实表达；Sanger测序结果证实了随机选取的其中2个miRNA的序列真实性。共预测出249个靶基因，其中分别有249, 118, 136和3个靶基因可注释到Nr,Swiss-Prot, KOG和eggNOG数据库。此外，分别有134和71个靶基因可分别注释到GO数据库的30个功能条目和KEGG数据库的54条通路。【结论】本研究揭示了东方蜜蜂微孢子虫孢子中miRNA的存在和表达；这些miRNA通过调控潜在靶基因的表达参与孢子的生命活动。

来源：2022年第6期

《昆虫学报》期刊编辑部

查看昆虫学报杂志2022年第6期