昆虫学报

作者：李莹,雷煜宇,梁世梅,章贤,杜杰,杨新峰,李闪闪,段建平

单位：1. 南阳师范学院, 河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室, 昆虫生物反应器河南省工程实验室, 河南南阳 473061; 2. 河南省蚕业科学研究院, 郑州 450008

关键词：柞蚕；基因组注释；全长转录组；蛋白编码基因；lncRNA,保幼激素酸甲基转移酶基因

【目的】优化柞蚕Antheraea pernyi基因组注释，更好地扩展其在比较基因组学及品种改良研究中的应用。【方法】对柞蚕进行全长转录组测序分析；经全长转录本与参考基因组比对，鉴定新基因及新转录本，并对这些新基因和新转录本进行功能注释及长链非编码RNAs (lncRNAs)预测。利用大量的蛋白质编码转录本和lncRNAs对柞蚕基因组中基因结构进行修订。最后创建矫正后的柞蚕基因组基因注释。【结果】新发现1 997个蛋白编码基因和3 399个lncRNA基因，分别由2 402个和3 574个全长转录本数据支持。发现柞蚕基因组含25 021个基因，其中19 825个基因是蛋白编码基因，包括7个保幼激素酸甲基转移酶基因。【结论】本研究促进了对柞蚕基因组基因注释信息的认识，为柞蚕及相关物种功能基因组及比较基因组学研究提供了很有用的数据资源。

来源：2021年第11期

《昆虫学报》期刊编辑部

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