昆虫学报

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:11-1832/Q

国际刊号:0454-6296

昆虫学报杂志2020年第8期:绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析

发布日期:

作者:王丹阳,王予彤,于良斌,韩海斌,徐林波,崔艳伟,康爱国,庞红岩

单位:1. 中国农业科学院草原研究所, 呼和浩特 010020; 2. 内蒙古农业大学, 呼和浩特 010020;3. 河北省张家口市康保县植保站, 河北张家口 076650

关键词:茧蜂科,优茧蜂亚科,绿眼赛茧蜂,线粒体基因组,系统发育

【目的】测定绿眼赛茧蜂Zele chlorophthalmus线粒体基因组全序列,分析其基因组结构及茧蜂科(Braconidae)部分类群的系统发育关系。【方法】利用Illumina MiSeq二代测序技术对绿眼赛茧蜂的线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释,分析其结构特点和碱基组成;基于22种茧蜂科昆虫的COX1蛋白编码基因序列,应用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统发育树,分析绿眼赛茧蜂与茧蜂科其他昆虫的系统发育关系。【结果】绿眼赛茧蜂线粒体基因组全长16 661 bp(GenBank登录号: MG822749),包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,共37个基因,以及1个控制区。线粒体基因组有明显的核苷酸组成的偏倚,AT偏正,GC偏负,其A+T含量为82.83%。基因排列顺序与推测的昆虫祖先的序列不完全一致,tRNA基因7处发生重排。13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子,以TAA为终止密码子。在22个tRNA基因二级结构中,除tRNAHis(H)缺失TΨC环和tRNACys(C)仅剩二氢尿嘧啶(DHU)臂和反密码子臂外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。基于COX1蛋白编码序列的系统发育分析结果显示,与绿眼赛茧蜂亲缘关系最近的是同属于赛茧蜂属的雪跗赛茧蜂Z. niveitarsis。【结论】本研究首次获得绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列。结果表明绿眼赛茧蜂隶属于优茧蜂亚科(Euphorinae)赛茧蜂属,并支持赛茧蜂属的单系性。

来源:2020年第8期

《昆虫学报》期刊编辑部

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